Para jugar Pokémon TCG en línea hay varias formas, la más común es sin duda utilizando el programa Apprentice.
Este programa está originalmente diseñado para jugar Magic: The Gathering vía internet, así que para poder jugar Pokémon deberás bajar un "parche", mismo que debes bajar, descomprimir e instalar en el directorio en donde esté instalado tu apprentice, (pongamos de ejemplo C:/apprentice) sobreescribiendo los archivos de Magic que ya vienen instalados.
Apprentice 1.46 con parche (Base - EX: Team Aqua & Magma) incluido
El parche incluye todas las tarjetas y promos desde el Base Set, así como los vending machines, southern islands y diversas cartas que sólo salieron en Japón o que aún no salen en américa.
Siempre puedes encontrar gente a quien retar dentro de los foros donde se organizan torneos periódicamente.